Déclarées zone contaminée suite à l'infection de variole atypique, les urgences sont fermées. Alors que tous les patients du service sont redirigés vers d'autres hôpitaux, Lockhart, Carter, Chen, Pratt et le SDF Stan sont mis en quarantaine pour deux semaines. Romano est grièvement blessé en tentant d'évacuer un patient par hélicoptère. Susan Lewis, quant à elle, reste coincée sur le toit avec un patient à l'agonie. Après deux semaines, les urgences sont enfin en mesure d'ouvrir à nouveau leurs portes. Pendant ce laps de temps, Elizabeth était partie travailler à Londres dans l'hôpital de son père. Mais la chirurgienne réalise qu'elle ne parviendra pas à trouver sa place et décide de retourner exercer à Chicago...